百日咳杆菌在体外很快死亡。所以，很少通过衣物、用具等间接传播。另外，人群对百日咳普遍易感、小儿时期尤其是婴幼儿时期最强，这是因为妊娠期间母体没有百日咳杆菌抗体由胎盘传给胎儿，因此，出生后的新生儿即可感染本病。年龄愈小，死亡率愈高，患过百日咳后可获得持久性免疫力，一生得两次百日咳极少。
从发病开始至出现痉咳，一般1～2周。开始症状类似感冒，除咳嗽外，可有流涕、喷嚏、低热，也可只有干咳。当其他症状逐渐消失时，咳嗽反而加重，日轻夜重，渐呈痉咳状。
值得强调的是，在临床上小婴儿的症状特殊，常无痉咳及典型高调吸气声，而常表现为阵发性呼吸暂停、青紫、甚则出现抽搐。还有一些成人或年长儿和经过预防接种的小儿百日咳症状可轻而不典型，仅有2～4周或更长时间干咳、缺乏阵发性痉咳。
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